Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vps41Q5KU39 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms