Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp22Q5DU02 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms