Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chsy3Q5DTK1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms