Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ndufaf2Q59J78 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndufaf2Q59J78 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms