Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccnl1Q52KE7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccnl1Q52KE7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccnl1Q52KE7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccnl1Q52KE7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccnl1Q52KE7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccnl1Q52KE7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms