Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhox3aQ4TU90 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms