Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms