Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed1Q3V009 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms