Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn4Q3UV66 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms