Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skap1Q3UUV5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skap1Q3UUV5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms