Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm28047Q3US59 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms