Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nhlrc4Q3UP44 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nhlrc4Q3UP44 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc4Q3UP44 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc4Q3UP44 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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