Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem253Q3UNB8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem253Q3UNB8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms