Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms