Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrxosQ3UL53 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CrxosQ3UL53 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms