Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ell2Q3UKU1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ell2Q3UKU1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms