Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc34Q3UI66 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms