Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Nkx6-3Q3UHX8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Nkx6-3Q3UHX8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Nkx6-3Q3UHX8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Nkx6-3Q3UHX8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx6-3Q3UHX8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Nkx6-3Q3UHX8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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Nkx6-3Q3UHX8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Nkx6-3Q3UHX8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Nkx6-3Q3UHX8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Nkx6-3Q3UHX8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Nkx6-3Q3UHX8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Nkx6-3Q3UHX8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Nkx6-3Q3UHX8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkx6-3Q3UHX8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms