Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nom1Q3UFM5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms