Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Puf60Q3UEB3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Puf60Q3UEB3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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