Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Wdr41Q3UDP0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms