Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3U6N9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3U6N9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms