Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q3U595 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q3U595 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U595 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U595 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U595 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U595 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U595 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U595 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q3U595 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q3U595 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q3U595 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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