Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc9Q3U0M1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc9Q3U0M1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms