Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc28Q3TX51 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc28Q3TX51 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms