Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Srsf6Q3TWW8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Srsf6Q3TWW8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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