Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3TTJ4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3TTJ4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms