Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fndc4Q3TR08 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fndc4Q3TR08 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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