Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc102aQ3TMW1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms