Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp39Q3TIX9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms