Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem248Q3TBN1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem248Q3TBN1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms