Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms