Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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Shroom4Q1W617 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Shroom4Q1W617 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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Shroom4Q1W617 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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Shroom4Q1W617 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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Shroom4Q1W617 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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Shroom4Q1W617 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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Shroom4Q1W617 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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Shroom4Q1W617 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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