Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ptchd1Q14B62 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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ptchd1Q14B62 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ptchd1Q14B62 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ptchd1Q14B62 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ptchd1Q14B62 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ptchd1Q14B62 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ptchd1Q14B62 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ptchd1Q14B62 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ptchd1Q14B62 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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