Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VgfQ0VGU4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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VgfQ0VGU4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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VgfQ0VGU4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VgfQ0VGU4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms