Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp2b3Q0VF55 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms