Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpne7Q0VE82 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpne7Q0VE82 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms