Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrriq1Q0P5X1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrriq1Q0P5X1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrriq1Q0P5X1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrriq1Q0P5X1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrriq1Q0P5X1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrriq1Q0P5X1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrriq1Q0P5X1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
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