Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms