Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SctQ08535 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SctQ08535 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SctQ08535 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SctQ08535 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SctQ08535 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SctQ08535 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SctQ08535 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SctQ08535 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SctQ08535 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SctQ08535 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SctQ08535 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SctQ08535 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SctQ08535 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms