Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms