Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf1Q07802 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms