Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Col9a2Q07643 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms