Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nfe2Q07279 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nfe2Q07279 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms