Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms