Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms