Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdcd1Q02242 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdcd1Q02242 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms