Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec23aQ01405 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms