Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Grin2cQ01098 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms