Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Grin2bQ01097 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Grin2bQ01097 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms